Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms