Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms