Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258 ms