Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms