Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAD1Q99259 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAD1Q99259 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms