Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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