Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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