Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CHFRQ96EP1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CHFRQ96EP1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CHFRQ96EP1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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