Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms