Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms