Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRSK1Q8TDC3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRSK1Q8TDC3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms