Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL2Q8NHH9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms