Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMGNT2Q8NAT1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms