Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms