Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC117Q8IWD4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms