Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms