Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms