Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms