Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms