Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF6Q6KF10 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDF6Q6KF10 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms