Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP350Q5VT06 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms