Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms