Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6CQ53S08 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms