Protein–RNA interactions for Protein: Q53LP3

SOWAHC, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOWAHCQ53LP3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOWAHCQ53LP3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOWAHCQ53LP3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms