Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms