Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN3Q4LDR2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms