Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LRRC36Q1X8D7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LRRC36Q1X8D7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LRRC36Q1X8D7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LRRC36Q1X8D7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC36Q1X8D7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms