Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNOP1Q1ED39 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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