Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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