Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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