Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms