Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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