Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD3Q15054 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD3Q15054 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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