Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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