Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PCLAFQ15004 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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PCLAFQ15004 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PCLAFQ15004 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PCLAFQ15004 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PCLAFQ15004 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PCLAFQ15004 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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