Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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