Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms