Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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