Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR4Q13639 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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