Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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