Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMS2P3Q13401 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms