Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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