Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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