Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIK2Q13002 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms