Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFX1Q12986 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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