Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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