Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
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