Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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