Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS3BPQ08380 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms