Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms